Acasă

Educaţie

Stiinţă

CodonCode Aligner Sequence Assembler 3.7.1

Developer's description

File details

Antivirus report

Published by CodonCode Corporation on 2 Nov 2010

Size
34.18 MB
License
Commercial
OS
Mac OS, Windows
Price
$720 Buy full version
Developer
CodonCode Corporation
Updated
2 Nov 2010
Downloads
102 (1 last week)

"Asamblare și aliniere secvență ușor de utilizat"

CodonCode Aligner este un software ușor de utilizat pentru asamblarea secvenței ADN, aliniere, editare contig și detectarea mutațiilor. În plus față de caracteristicile comune în programele de asamblare a secvențelor, cum ar fi tăierea finală, alinieri la secvențele de referință, ADNc la alinierea ADN genomică și export, CodonCode Aligner oferă multe caracteristici unice care nu se regăsesc în alte programe software.

            Caracteristicile avansate CodonCode Aligner includ:
            - Asamblați după nume: construiți sute de contiguri în câteva secunde, pe baza numelor de mostre
            - Secvențe de consens exacte bazate pe calitățile secvenței elimină nevoia de a edita discrepanțele banale
            - Contiguri de contiguri: aliniați contigii una cu cealaltă cu ClustalW și reveniți la urmele de bază cu un dublu clic
            - Automatizați cu procesare cu un pas și scripturi
            - Analiza mutației sensibile cu instrumente unice pentru analiza inserțiilor și ștergerilor heterozigote
            - Utilizați instrumente de top cum ar fi Clustal, MUSCLE, Phred și Phrap în cadrul CodonCode Aligner
            - Vizualizați mai bine secvențele dvs. ABI cu ajutorul clarificării urmelor CodonCode Aligner
            - Priviți diferențele cu tabelul de diferențe și măriți contigurile
            - Construiți copaci de legătură cu vecinii pentru a sorta probele dvs. în funcție de diferențe

            CodonCode Aligner este ușor de învățat și de utilizat, dar puternic și personalizabil. Acesta include un ajutor extensiv, sensibil la context, cu instrucțiuni și explicații despre „cum să” despre algoritmii folosiți. CodonCode Aligner este utilizat pe scară largă în filogenetica, cercetarea evoluției, biogeografie, detectarea mutațiilor și alte zone de cercetare biomedicală.

            Descărcarea este o versiune de încercare care este complet funcțională timp de 30 de zile. Poate fi convertită într-o versiune completă prin achiziționarea unei licențe. Licențele pentru CodonCode Aligner sunt substanțial mai puțin costisitoare decât licențele pentru pachete software comparabile. Licențele „plutitoare” sunt disponibile fără costuri suplimentare și pot fi partajate între Windows și Mac OS X.

Requirements: Windows 2000 or newer, Mac OS X 10.4 or newer

What's new in this version: New: Neighbor-Joining trees Zooming in alignments & assemblies Automatic reference sequence shortening after alignments Mask low coverage regions New and flexible consensus methods Set base numbers Automatic name scheme definitions for "Assemble & Align by Name" Customize toolbars directly through popup menus Rebuild the consensus See http://www.codoncode.com/aligner/new.htm

Download CodonCode Aligner Sequence Assembler 3.7.1 (34.18 MB)

Buy CodonCode Aligner Sequence Assembler's full version ($720)

Click here to fix Windows errors and optimize system performance. (advertising)

Top user review

There are no user reviews. Be the first to review this software.

Antivirus information

Download3K has downloaded and tested CodonCode Aligner Sequence Assembler on 22 May 2012 with some of Today's best antivirus engines and you can find below, for your convenience, the scan results:

Avira:
Clean
Bitdefender:
Clean
Kaspersky:
Clean
NOD32:
Clean